Tiga puluh tahun yang lalu, makhluk asing datang ke Bumi bukan untuk menaklukkan atau memberikan bantuan, melainkan untuk mencari perlindungan dari planet mereka yang sekarat. Mereka dipisahkan dari manusia di sebuah kawasan di Afrika Selatan yang disebut District 9. Para alien tersebut diawasi oleh perusahaan bernama Multi-National United, yang tidak peduli pada kesejahteraan mereka dan hanya berambisi menguasai teknologi canggih milik para alien. Namun, ketika salah satu agen lapangan perusahaan itu terinfeksi virus misterius yang mulai mengubah DNA-nya, hanya ada satu tempat di mana ia bisa bersembunyi: District 9.